1、水利机构管理体制不完善

　　农民参与程度低：农民参与小型水利工程的管理体制虽在某种程度调动了农民参与水利工程管理的积极性，但由于管理体制的不健全，农民参与不积极。农民没有把水利设施视为与自身利益相关的农业生产设施而积极地参与到工程的维护管理，农民不了解也很少参与小水利工程的有关管理决策，农村水利组织的领导或成员大多数南组织安排或自愿参加，民主选举的却很少。

　　2、水利管理机构运行资金不足

　　运营不合理：由于过去政府主部门一直只注重农村水利工程固定资产投资量的增加，而忽视对已建农村水利工程的管理，形成了对农村水利设施只建不管、重建轻管的现象。在建设水利工程时，往往未将建后的管理机构和管理费用落实，对农村水利工程维护管理重视不足，资金投入较少，从而造成了一年建设三年坏的现象，影响工程效益的发挥。如以前建设的高稳产农田工程和近几年建设的排水工程等，除了一些沟渠、泵房、水池、水窖和小塘坝之外，相应配套的管道、闸阀、机电没备等已经大部分报废。农村小型水利工程管理机构资金不足现象普遍存在，尤其是一些小型的水利设施，其收入来源比较单一，主要依靠灌溉水费收入，而支出项目较多，如水利工程维修费、折旧费、电费等，个别机构存在支出大于收入的情况。农村水利机构入不敷出的资金运行状况，必然会降低农村水利机构人员工作积极性，从而影响农村水利管理机构的良好运营。如小型灌区、提灌泵站或人饮泵站，能收取的费用最多只能维持管理人员的工资、电费等，维护及维修费用缺乏，设备、设施一出现问题，就闲置报废。

　　3、水利工程管理效率不高

　　于水利工程管理职能不到位、运营方式单一、管理组织不健全等问题，使得农村水利工程的管理效率不高，不能调动水利工作人员积极性，水利工程正常运行得不到保障。一些地方灌排渠道和农村河道工程仅有很少部分落实了管理机构，小型以下水库没有设管理机构，由乡镇、街道专管员负责管理，渠道仅由村民自主季节性管理。一些地方部分小水库、塘坝、自流、提水及小灌区，机电井和河道防洪工程处于无人管理状态，这样会造成管理机构的职员对水利事业关心淡薄，从而影响水利机构正常效益和职能的发挥。如～些有管理房的小水库、塘坝和小灌区，由于多年没有上调管理人员的工资，因待遇很低，管理人员为了生计忙于其它事，管理房每天就只有一把锁和～条狗，这样的现象很常见。

　　4、在重建轻管，缺乏维护的问题

　　缺乏维护的问题主要表现在：①领导思想上存在重工程建设、轻工程管理的倾向，认为管理难度大。这是因为领导的政绩要依靠项目和资金来体现，对于管理来说难以体现。②管理经费无保障。在兴建工程时，没有很好地考虑工程建成运用后的运行维护经费，管理设施简陋，管理人员经费不落实，形成工程建设越多，背的包袱越重的恶性运行机制。导致管理人员缺乏责任心，消极怠工，甚至脱岗转行。⑧产权不明晰，主体不明确。小型水利工程多是靠国家拨一部分资金、物资，农民义务投工投劳来完成，投资主体很不明确。主要反映在产权归属及管护主体之上。④宣传教育缺乏深度，工作缺乏力度。水利设施被毁被盗现象严重，没有形成全民爱护的意识。⑤管理部门力量薄弱，管理知识缺乏，业务水平偏低。因工程点多面，～，大部分交由村委会或自然村负责管理，管理人员多是当地农户，根本不具备相应的知识和业务。