1、水利工程对河流生态环境的影响

水利工程通常都是建立在自然河道的基础上，所以水利工程的建设，会对由河流长时间的演化成的自然生态环境造成一定的影响，结果可能造成河流局部的非连续化和均一化，这样河流在长期的作用之下，原来河流的多样性环境就发生了改变。一些大型的水库建在河流之上，水库的建筑材料的独特性质会对水温和水质都造成一定程度的影响。在太阳光的强烈照射下，水温会提高很多，这样水质受到影响后，水中的水生物的生活和繁殖都会受到影响。这样的河流就不再是它的原始状态。水利工程的建设还会降低原有的河道水的流速，这样水面与空气的接触交换速率也就减小，水的自净能力也降低。

2、水利工程建设对河道附近的生态环境的影响

水利工程建设对河道附近的生态环境的影响主要体现在河道周边的植被受到的重要影响。由于水利工程的施工建设，对河道周围的陆生生物环境造成严重的影响，河道理化性质的改变，使岸边的生物生存以及生活环境逐渐变得恶化。这样生活在河道周围的大部分生物由于环境的恶化会被迫迁徙，这样施工区域的生态系统就失去了原有的平衡，如果没有合理的保护措施，很可能造成物种灭绝的危险。