1.物理一化学评估

　　物理一化学评估作为河流健康评估指标之一，是因为这些指标可以反映河流水流和水质变化、河势变化、土地使用情况和岸边结构。物理量测参数包括流量、温度、电导率、悬移质、浊度、颜色。化学量测参数包括pH值、碱度、硬度、盐度、生化需氧量、溶解氧、有机碳等。其他水化学主要控制性指标包括阴离子、阳离子，营养物质等（磷酸盐、硝酸盐、亚硝酸盐、氨、硅）。

　　在河流健康评估中应突出物理一化学量测参数对河流生物群落的潜在影响。比如总磷、总磷／总氮和叶绿素等，可能导致水体的富营养化；由于盐的输入可能改变电导率造成某些敏感物种死亡；生化需氧量（BOD）的降低会引起生物窒息，造成鱼类死亡；由于泥沙输移造成悬移质和浊度变化，引起淤积和地貌特征变化，改变吸附在泥沙颗粒表面上的营养盐的输移规律及栖息地质量；由于污染引起pH值、有机物和金属等

　　参数变化，可能造成敏感生物的减少等。

　　一些机构和研究者倾向于综合各种水质指数为一组简单的水质指数，目的是可以满足社会公众对于水质的关注需求。这种非专业的综合水质指标采用数量不多的指数作为一种工具，可以表示水体受损的相对水平，也可以对于水质改善过程进行评估，并且研究随时间演变趋势。

　　2.生物栖息地质量评估

　　生物栖息地评估的内容是勘查分析河流走廊（rivercorridor）的生物栖息地状况，调查生物栖息地对于河流生态系统结构与功能的影响因素，进而对栖息地质量进行评估。具体体现在河流的物理一化学条件、水文条件和河流地貌学特征对于生物群落的适宜程度，特别是对于形成完整的食物链结构和完善的生态功能的作用。

　　生物栖息地质量的表述方式，可以用适宜的栖息地的数量表示，或者用适宜栖息地所占面积的百分数表示，也可以用适宜栖息地的存在或缺失表示。

　　栖息地评估的变量指数可以包括以下内容：（1）传统的水文和水质条件，包括径流变化与参照系统的对照、水体污染、水库人工调节影响等；（2）河流地貌特征，主要评估栖息地结构和河势稳定性，包括河流蜿蜒性、河床的淤积与冲刷、岸坡稳定性、人工渠道化程度、闸坝运行影响等；（3）河道构造，按照尺度、河床材料、本底材料和河道改造进行描述；（4）岸边植被，指评估岸边带植被数量和质量，包括植被宽度、顺河向植被连续性（用植被间断长度表示）、结构完整性（指各类植物的密度与自然状态的比较）、当地乡土物种覆盖比例及再生性状况、湿地河洼地状况等；（5）河流周围社会经济发展状况，包括人口、经济结构、土地利用方式变化以及城市化影响等。

　　3.水文评估

　　水文评估的目的是分析水文条件的变化对于河流生态系统结构与功能产生的影响。引起水文条件变化的因素很多，包括由于气候变迁引起的径流变化、上游取水增减变化、由于水库调度和水电站泄流改变了自然水文周期、土地利用方式改变和城市化引起的径流变化等。所谓水文条件，既包括传统的水文参数，还包括水流的季节性特征和水文周期模式、基流、水温、水位涨落速度等，这些都对鱼类和其他生物的栖息繁衍产生影响。

　　水文评估中具有研究性质的课题有两个：一是建立河流水文特性与生态响应之间的关系，特别是水流变动性与生态过程的关系，从中分析对于河流生物群落有重要影响的关键水文参数；二是通过水文长系列资料分析认识河流地貌演变及生态演替的全过程。每一条河流都有自己的特性，因此这两个问题的答案都是各不相同的。

　　在确定水文变化参数时，以哪一种径流模式为基础，不同河流各有侧重。有的国家的规范考虑用平均年径流指数给出总水量变化，用不同频率的洪水月径流过程曲线给出水流模式的变动，用水流季节比例指数变化的模式评估季节变化，季节峰值指数评估季节最高和最低水位。水文评估方法应力求简单明了，具有可操作性。

　　评估的基本方法是对比现实的水流模式与理想的自然状况的水流模式，通过两种水文参数的比较，得到一个相对的无量纲的指数，评估以记分的形式表述。

　　4.生物评估

　　河流生物群落是河流生态系统的主体。生物评估具体是分析水文条件、水质条件和栖息地条件发生变化对于河流生物群落的影响程度。可能产生的变化包括水域生物群落物种成分变化、栖息地生物优势种群的变化、物种枯竭、整个种群死亡率、生物行为变化、生理代谢变化、组织变化和形态畸变等。

　　基本评估方法是与参照河段的生物状况以记分的方式进行对比。“参照河段”一般选取水质、河流地貌以及生物群落基本未受到干扰的河段。