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　　1、农田灌溉基础设施依然薄弱

　　目前。由于水资源紧缺、水源保障工程不足、水资源调蓄能力低。全国有半数的耕地没有灌溉水源或缺少基本灌排条件现有灌溉面积中灌排设施配套差、标准低、效益衰减等问题依然突出，全国50%以上的中小型灌区及小型农田水利工程基础设施不配套和老化失修。大多数灌排泵站带病运行效率低下。农田水利“最后一公里”问题仍然很突出特别是遇到严重干旱时供水不足，易导致大面积受灾，遇到较强暴雨容易造成农田渍涝。

　　2、建设标准不高

　　目前，水利工程实施部门多。各部门分别编制规划。分头组织实施。缺乏统一的指导性规则和规范的建设标准。造成农田水利工程基础设施建设中普遍都存在设计准参差不齐。难以统一考核评价。此外。农田水利工程基础设施建设具有点多、线长、面广等特点。加之工期要求又紧（秋收后才能开始建设。必须在次年春灌前完工），致使在水利工程施工管理、质量控制等方面存在闲难较多。建设质量难以把握。

　　3、资金来源分散

　　由于建设资金的多元化。形不成合力。造成许多农田水利基础设施建设标准低，多数农田建设项目难以同步实施土壤改良、地力培肥、耕作节水等措施。工程建设后效益难以得到充分发挥。

　　4、工程建成后管理维护效机制为建立

　　农田水利工程基础设施建设中“重建设、轻管护”的现象较为普遍。农田水利工程基础设施产权不清晰。建后管护责任和措施不到位。管护资金不落实等问题突出部分项目竣工移交后设备和设施损毁。得不到及时、有效的修复。加之维护费用缺乏。使很多设施使用寿命大大降低。工程效益值得不到充分发挥。

　　5、农民节约用水意识淡薄，地下水开发严重

　　由于人口增长和用水效率的低下。能够获取的地表水资源日趋减少农业灌溉越来越依赖地下水在北方地下水已经成为农业灌溉的最主要水源。但农业灌溉取地下水无需交纳水资源费，地下水开采用于灌溉管理得较松散。在农民看来取地下水灌溉是天经地义的事。地下水的过度抽取给整个地下水的回补修复带来难度。并导致一系列的生态问题。