（1）采取必要的政策保护措施：在该农田水利工程项目建设的过程中，需要以乡镇为单位进行组织施工。在统一规划的基础上进行建设，并根据统一标准实施奖补措施。对于施工技术含量较高、施工时间紧迫、施工任务沉重的工程，需要由水利局进行组织，安排专业化施工作业，按照国家相关的定额标准对工程进行结算。

（2）施工技术保障措施：该农田水利工程主要是由水利局组织建设的，工程设计以及监理工作都是由水利局组织进行的。另外环保局需要对灌区的环境保护效果进行监测，农业局则要对灌区粮食增产的实际效益进行监测，计划部门通过总结上述监测结果做出最后的综合评价。

（3）资金管理措施：在该农田水利工程建设中需要严格实施专户管理，通过设置专户储存，做好财会工作，确保各种款项能够用到专门的建设项目中。

（4）工程建设过程中的管理措施：在该农田水利工程建设中，需要进一步落实项目法人制，通过实施招投标制度确定合适的承包人，并利用施工合同严格规范各个施工方，规范组织施工，做好监督管理工作，防止出现豆腐渣工程。