在知识经济时代，企业之间的竞争是知识产权的竞争，因此知识产权贸易在企业并购的运作中处于相当关键的地位。在并购中，知识产权作为无形资产主要通过两种方式处置，一是作为投资，投资方，用商标、专利或专有技术作投资去兼并、购买目标企业或对该企业实行控股。二是转让买卖，

　　即作为目标企业的中方企业被购买兼并时将自己所拥有的商标、专利、专有技术随同其他财产一并转让给兼并方。

　　在并购中，作为被购并方应当重视自己的知识产权，十分珍惜自己在长期经营过程中形成的知识产权，发挥无形资产的优势，实现知识产权在并购后的保值增值，保证己方的长远利益。但是国内企业在利用外资时，为了扩大生产规模，将技术投入作为引资的条件，但对该技术既未申请专利保护，在并购过程中也未在合同中以及实际的操作中将其作为专有技术加以强有力的保护，从而使这一部分无形资产白白流失。鉴于此，作为被购并方应当科学评估自己的知识产权，计算知识产权的回报，并合理地把它们体现在企业的财务状况上，这是使知识产权有序进入市场进行交易的基础。要尽量争取保留知识产权的所有权，比如在并购中只出让商标的使用权，这样即使并购后在外方控制下的企业不用中方的商标，中方自己仍可继续使用原有商标，而不致造成商标因长期得不到使用而淡出市场的后果。要争取新知识产权的权利，并购后所产生的新的技术、新的商标是在原有知识产权基础上不断产生的新的知识产权。国内企业应尽量争取对这些知识产权的权利。

　　作为购并方，在并购意向确定后，应当委托专业的中介机构对目标企业进行调查，对知识产权尽职调查首先要看目标企业拥有哪些知识产权，但不仅仅看看将企业的专利、商标、著作权等知识产权列出明细表，对照各种权利证书，查看会计师事务所的价值评估报告。以发明专利为例，尽职调查时不仅要看是否拥有发明专利，还要看企业是否按时缴纳专利年费，有时还会研究发明专利的保护范围。对于重要的专利，还要对其被宣告无效的可能性作出评估。仅仅由于专利的权利要求书写得不完备，而令收购企业放弃的事例也并不少见。权利要求书不完备会使专利保护范围过窄，令竞争者容易绕过该项专利。在欧美国家，许多企业每年或者不定期会聘请第三方机构对自身进行知识产权审计，即将拥有的知识产权进行一次盘点和检查。被收购的企业在接受知识产权尽职调查前，如果能进行知识产权审计，企业可以及时发现存在的问题并采取必要措施解决，避免因知识产权存在问题而使企业价值被低估，或者使并购项目夭折。