1、对水质的影响

水库建设施工期间由于工程残渣、生活垃圾等不可避免的会对水质造成一系列不好影响。水库蓄水后，被淹没土壤中的有害物质和营养物质被水溶解，引起水库水质下降；水库建成后，由于水库蓄水，上游水体由河道型变为湖泊型，库区及上游游速减缓，一方面库水滞留时间增加，有利于有机污染物在水库中降解净化，生化需氧量的降解量要比建库前天然河流状况下增加；另一方面库水流速减缓，复原能力减弱，将使生化需氧量降解量减少。

主要表现为水库水体盐度增高、水库水温分层、库中藻类繁殖加剧等。

2、对河流水文特性的影响

大坝拦断江河后，会淹没上游的土地，对天然河流的水文情势产生了一定的影响，同时会产生大量移民。移民及城镇的建迁会加剧人地矛盾，并南此加剧植被的破坏、水土流失和生态恶化，同时也将改变整个河流的水文情势，比如水量、水温、流速、水位及对泥沙的影响。其中，影响最大的是多年调节型水库，影响相对较小的是日调节型水库。水库水位的变化与天然江河大不相同，这取决于不同类型的调节方式，以防洪为主要目的的水库，其水位的变化在季节上与天然河流是相反的，水位变幅较大，讯期水库处于低水位运行；在汛末蓄水，水库处于高水位运行。这样，增加了江河枯水期流量，减少了丰水期流量，提高了下游的防洪标准。同时，提高了下游丁业生产和农业灌溉的用水保证率，增加水电站的保证出力。

因为流域内的地表水与地下水有密切联系，河流水文条件的改变必将影响地下水的水位与水质变化。坝址上游水库蓄水使其周围地下水水位抬高，从而扩大水库浸没范围，导致土地的盐碱化和沼泽化。同时，拦河筑坝也减少了坝库下游地区地下水的补给来源，致使地下水水位下降，大片原有地下水自流灌区失去自然条件，从而降低了下游地区的水资源利用率，对灌溉造成不利影响。

3、对生物多样性的影响

大坝兴建后，库区本身由于水面增加，水流变缓，由河道型变为湖泊型，水文条件改变较大，水中的营养盐类、悬浮物以及沉淀物都将有所改变。

首先，水库对陆生动植物额影响。水库建设需要大量的移民、施工以及库区形成的蓄水淹没，淹没陆生动植物的栖息地，破坏原陆生植物系统，引起资源的变化。其次，对水生动植物的影响。此类影响更为复杂，不仅限于库区的淹没与动物柄息地环境的改变，还影响水库下游河段水生动植物及其栖息环境。生物物种因其生存和生活空间的丧失而面临濒危或灭绝。

4、可能诱发地震或者滑坡

水库蓄水以后，迫使上游及其支流水位抬高，水库两岸在水体浸泡下，会产生个再造的过程，可能会诱发库岸崩塌、山体滑坡、地震等灾害。此外，水库蓄水增加后压力加大，可能会增加引发地震的频次、加大地震的级别。当然并非所有发生在水库附近的地震都是由水库本身引起的。