灌溉用水总量控制的目的是实现水资源的优化配置、高效利用和有效管理。按照这个思路，首先应确定可分配水量控制指标，这个指标主要依据流域水资源承载能力以及分配水资源的原则。各县依据这个指标，综合考虑当地各种优势，合理调整经济结构，优化配置资源，按照经济社会与人口、资源、环境协调发展的要求，合理确定生活、工业、农业用水指标。农业用水指标包括灌溉用水和其他农业生产用水，还应逐步细化到农业用水管理单元（例如乡、镇），作为考核、管理现有农业用水和审批新增农业用水的主要依据。在灌溉用水定额按照作物确定后，影响灌溉用水总量的主要因素是作物种植结构和灌溉规模。应该看到，农业结构调整的内在动力是追求比较效益的提高。种植结构调整的这种价值取向符合“经济体制由计划经济向市场经济，经济增加方式由粗放型向集约型转变”的根本要求，因此也应该是灌溉用水优化配置的根本原则。但是种植结构调整必须充分考虑水资源的承载能力，也就是说，必须在灌溉用水总量受到限制的前提下，追求比较效益的提高。即比较效益的最大化是目标，灌溉用水总量是约束条件，种植结构、灌溉规模、灌水技术等是决策变量，是一个有约束的优化问题。在灌溉用水总量控制指标不能满足一定种植结构。