四川省审计厅厅长李高伟在审计报告中指出，四川省财政厅在具体组织预算执行中存在项目库管理制度执行不力有待完善、结转项目资金结余管理使用不够严格等问题，省地税局也存在对个别企业税收减免审查不严、漏计欠税严重等问题。
据《天府早报》报道，27日，四川省2004年审计报告正式出台，这是四川省审计公开制度实施第二年，听取报告的人大代表建议报告中罗列出具体单位的具体处理建议，年底前政府部门将相关处理结果向人大常委会汇报。
在审计省经委、交通厅、卫生厅、商务厅、外办、计生委、总工会、团委、妇联、农机局、中医药局、宗教局等部门及下属单位的过程中，发现决算反映不够真实完整、二次预算的管理分配不够规范、收入未足额入库或缴存财政专户、挤占挪用专项资金、单位内部私存私放公款情况突出。
51个县自行组织的一般预算收入仅占可用财力的38%，至2003年底，有18个县欠拨医疗、养老等社会保障性资金共14428万元，有38个县欠账达95421万元。
专项资金违规违纪
2003年的审计报告中指出，4500多万元的扶贫资金被挤占挪用，9500多万元天然林保护工程资金使用中存在违法违规，今年的数据依然不容乐观，挤占挪用国土专项资金41289万元；不严格执行国家规定征收、管理国土专项资金，有9个市违规减免土地出让金及新增建设用地有偿使用费等24304万元。
二期农村电网建设与改造项目，一些单位虚增工程造价，工程决算不实17631万元；少数地方将行政性费用计入农网工程，挤占、挪用农网建设资金998万元；工程核算和管理不规范10531万元。退耕还林工程资金存在弄虚作假、专项资金被挤占挪用等问题。
检察机关侵占罚没款
少数检察院将罚没款滞留于单位账户，有的被截留、坐支；对应退当事人的暂扣款物未及时退还，有的被侵占、挪用；将尚未定性的暂扣款提前作罚没收入解缴入库；无依据向有关单位收取办案赞助费、咨询费、共建费及违规向企事业单位借款；违反票据管理规定，在收缴一些款项时，使用非财政部门统一监制的票据，导致部分收入脱离监管；收入不纳入财务统一核算，账外设账、公款私存。
