种植屋面防水遇到的最大难题是植物根系对防水材料的破坏，下面就植物根穿透常规防水系统的机理提出解决这一问题的根阻方法。
植物根穿透常规防水系统的机理
沥青基防水卷材由SBS或APP改性沥青涂层及胎基（聚酯胎、玻纤胎或复合胎）构成。沥青中含有一种植物亲和物质——蛋白酶，该种物质对植物来讲是一种营养物质，当植物根系接近该种物质后，根系会穿入沥青来吸收该成分，而普通的防水卷材胎基对植物根系的抵抗能力近乎为零，结果导致在常规改性沥青防水系统的种植屋面中，植物根系第一年就已经穿入了防水系统，接下来很短的时间内就造成了防水系统的破坏。
由普通高分子防水卷材组成的防水系统在植物根系面前表现怎样呢？显然由PVC或聚乙烯（PE）以及其他高分子材料做成的防水卷材不含有植物的亲和物—蛋白酶，植物不会主动攻击防水系统。可是，所有植物根系都有同样的生长特性—向水性及向下性，植物根系生长的巨大压力是众所周知的，否则岩石的缝隙上生长不出茁壮的小草和小树，普通的高分子材料比岩石的机械强度又如何呢？在上面FLL的根阻实验照片中，我们清楚的看到植物根系穿过PVC防水卷材的情景，而且在四年的实验中，做为对比实验的PVC防水卷材在第一年已经被植物根系所破坏。显然，不具备生物阻拦及机械阻拦的防水系统在植物根系面前是很脆弱的。
防止植物根穿透防水系统的机理——根阻作用原理
1、将抑制植物根生长的生物添加剂加入到防水材料中沥青涂层中，利用添加剂与植物根的生化反应，使植物根在生长到涂层中时，在添加剂的作用下角质化，从而达到抑制植物根继续生长的目的。
2、将防水材料的胎基用铜蒸汽处理，不但使胎基具有了一定的机械阻拦功能，而且同时还利用了铜离子的特性-植物根系遇到金属铜离子会改变生长方向，使得植物根不会再向下生长，从而达到阻止植物根继续穿透胎基下表面的沥青涂层的目的。
例如：某屋顶花园根阻系列产品，在弹性沥青涂层中（SBS）加入可以抑止根生长的生物添加剂，沥青是比较柔软的材料，很容易与添加剂融合，当根的尖端生长到涂层时，根在添加剂的作用下角质化，不会继续生长以至于破坏下面的胎基，从而使卷材还可以继续发挥防水功能。考虑到有的植物根的穿透
能力极强（特别是在重型绿化屋面上），我们再用铜蒸汽处理胎基，不但使胎基坚固，而且它经过国外专家研究，植物根系遇到金属铜离子会改变生长方向，从而使植物根系不会继续向下生长，胎基本身也具有根阻功能，这就给花园屋面的防水上了双保险。
结论
1、植物根穿透防水材料是造成种植屋面防水失败最主要原因。
2、植物根系的生长能力极强，
生长的深度也超乎我们的想象。覆土的厚度对改善植物根系的穿刺毫无意义，干旱地区灌木的根系在地下十米深处仍可以发现。
3、必须采用经过验证的植物根阻拦材料才能完成植物根系的阻拦，而且这种材料还要具有生物阻拦及机械阻拦的双重特性。
4、种植屋面是一个系统，各部分都是有机结合的；当植有竹子及芦苇时还要需要应用更完善的保护。
